全书共由十二章组成，内容主要涉及发酵技术与中医药及中医药现代化的历史渊源和紧密联系，中药发酵所需的工艺条件、菌种、生产设备，中药发酵后中药活性成分的分离、提取和精制及生物转化，中药配伍发酵即中医的复方发酵，并且讲述了目前前沿的药用真菌发酵和光合细菌发酵。其作用靶点可概括为：保护中药活性成分免遭破坏，使药物的有效成分、活性物质最大限度地得以提取和利用；提高中药药性，降低药物的毒副作用；所优选的人体有益菌种本身能补充或增强原有药物的功能，产生新的活性物质，为中药活性成分结构修饰提供新途径；节省药材资源，保护环境等。发酵技术在中医药中的发展需要中药学、微生物学、分析化学、药理学等多学科的参与，随着众多学科的交叉与融合，中药发酵技术在中医药领域也将发挥更加重要的作用。

第一章 绪论
第一节 发酵技术历史及现状
第二节 中药发酵历史及现状
第三节 中药发酵的特点
第四节 中药发酵的原理
第五节 中药发酵的应用价值
第六节 中药发酵的发展方向
第二章 现代生物技术与传统中医药
第一节 细胞工程与中医药研究
第二节 基因工程与中医药研究
第三节 微生物在中医药研究中的应用
第四节 其他生物技术在中医药研究中的应用
第三章 中药发酵工艺条件
第一节 培养基的选择和确定
第二节 培养工艺方法