超微细粉碎技术对于中草药粉碎具有重要的意义，但是中草药在超微粉碎过程中也会经常遇到一些难题。中药超微粉碎的个难题是纤维性较强。中药材的根、茎、叶一般起到贮藏、输送、固着等作用，但是这些部位的显著特点是纤维性较强。常见的中药中有37%的中草药为根或根茎类，如人参、甘草、黄芪、当归等。

　　中草药超微粉碎的第二大难点就是含油性、粘液质、多糖等成分较多的种子、果实和花类。常见的如枸杞子、生熟地、柏子仁等。这类物料粉碎时一般都要进行一定的前处理，不能直接粉碎。比如，烘干处理，然后混合粉碎，即掺入一些干性的物料来吸收其粘性和油性等，同时粉碎机配置低温装置，如水冷却、冷冻机冷却等，避免温度的升高产生粘结现象。

　　中草药的根、茎、叶、果多属于生物活性物质与热敏性物质，在粉碎加工中存在诸多难点。若采用普通粉碎机，粉碎过程会产生大量的热，使物料升温生物活性物料中的热敏性物质与生物活性物质会因粉碎过程中的升温过高失活或损失，令热敏性物料的性能指标降低或大部分失效。粉碎过程中也会引起物料的变性或变质，如果这种变性不是我们需要的，将会导致废品率升高。因此研制开发与推广一种适应于中草药的超微粉碎设备具有重要的现实意义。