对生产环境的要求也越来越严格了，所以在食品净化工程厂房内建造无菌室，提高产品的质量与生产效率。在无菌室使用前必须打开无菌室的紫外灯辐照灭菌30分钟以上，并且同时打开净台进行吹风。

    食品净化工程操作完毕，应及时清理无菌室，再用紫外灯辐照灭菌20分钟。无菌室的应用广泛，目前在半导体、光电子、生物工程等众多行业均有应用，根据行业的精密与无尘要求，等级差别也较大。

    食品净化工程清洁的环境还可延长净化工作台的使用寿命，凡与洁净室工作无直接关系的物品一律不能放入，以利保持无菌状态。食品净化工程的空气与外界空气应隔绝，预留的通气孔道应尽量密闭。通气孔道可设上下气窗，气窗面积宜稍大，需覆上4层纱布作简朴滤尘。在一天工作之后，可开窗充分换气，然后再予以密闭。在净化工作台安装前，要确定工作台的安装位置，保持洁净室内的干燥和环境的洁净，湿润的空气既会使制造材料锈蚀，还会影响电气电路的正常工作，湿润空气还利于细菌、霉菌的生长。

    食品净化工程的使用注意事项：在净化工作台上亦可吊装紫外线灯，但应装在照明灯罩之外，同时错开照明灯平行排列，这样在工作时不妨碍照明。若将紫外线灯装入照明灯罩(玻璃板)里面，这是没有用处的，由于紫外线不能穿透玻璃，灯管是石英玻璃，而不是硅酸盐玻璃制成的。净化工作台进风口在背面或正面的下方，金属网罩内有一普通泡沫塑料片或无纺布，用以阻拦大颗粒尘埃，应该经常检查、拆洗，做好日常净化工程的清洁工作。