荧光测汞仪的原理如下：

仪器采用过量的氯化亚锡与样品中的氯化gong充分反应,其反应式如下：HgCl2+snCl2-SnCl2+Hg（气体）生成的汞蒸汽在载气的带动下,从原子嘴中喷出,接受由低汞灯发出波长为253.7nm的激发光照射,基态汞原子被激发到高能态,当返回到基态时辐射出共振荧光,此荧光经聚光镜聚焦于光电倍增管,实现光电转换,光电流经放大（可用记录仪记录峰值）,A/D转换,由计算机处理,并可打印计算结果.当汞浓度很低时,荧光强度与汞浓度呈良好的线性关系,据此可用于痕量汞的定量测定.需要指出的是：受激的汞原子除了自发地返回基态而辐射荧光外,也会与背景粒子碰撞而把能量转变为粒子的热运动,因而产生了无荧光辐射的跃迁,降低了荧光强度,这就是原子荧光猝灭现象。

冷原子荧光法：此方法是将水样中的汞离子还原为基态汞原子蒸气，并吸收253.7nm的紫外线。在光照之后，激发产生特征共振荧光。在某些测量条件下和较低浓度范围内，荧光强度与汞浓度成比例。该方法的z低检出浓度为0.05ug/L，测量上限为1ug/L，干扰因子小，适用于地表水，生活污水和工业废水的测定。