无菌空气过滤的设计和应用是一套完整的系统工程，需要对系统环境、设备和运行统筹考虑。尤其是在空气质量恶劣的条件下，保证优良的无菌空气系统制备十分关键。此外，空压机的类型、气液和气固分离设备的使用效果、节能膜过滤器的选择、相关空气系统制备的补充和完善等，都是无菌空气过滤工程需要考虑的重要因素。
无菌空气过滤主要用于进气净化，除去其中的尘粒。此外，某些生产过程的排气中含有细小的污染物质(如放射性物质、油雾等)这类净化虽然属于排气净化，由于它净化要求高，也需采用空气过滤器。无菌空气过滤是指空气过滤装置，一般用于洁净车间，洁净厂房，实验室及洁净室，或者用于电子机械通信设备等的防尘。
无菌空气过滤的布置应符合以下要求：
当平行于装饰层或均流层布置在静压箱下部送风面上时，过滤器满布比应不小于0.75。
当布置在静压箱的侧面时，可以在单侧或是对侧进行布置，侧面的过滤器满布比不应小于0.75，静压箱内气流应有充分混合的措施。
当受到层高和不允许在室内维修的限制时，可采用有阻漏功能的送风面而把过滤器布置在静压箱之外，但应尽可能靠近静压箱，静压箱内气流应有充分混合的措施；洁净气流满布比应下小于0.85。
低于100级的洁净区，当集中布置送风口时，送风口内末级过滤器可以集中布置，也可以分散布置，但在送风面上必须设置均流层。
百级层流手术室所有洁净室，应采用双侧下部回风；在双侧距离不超过3m时，可在其中一侧下部回风，但不应采用四角或四侧回风。洁净走廊和清洁走廊可采用上回风。
百级层流手术室均应采用室内回风，不设余压阀向走廊回风。
百级层流手术室必须设上部排风口，其位置宜在病人头侧的顶部。排风口迸风速度应不大于2m/s。
