二手发酵设备是将物料放置于透气的尼龙材质带，由链轮机构拖动尼龙带缓慢运动，将物料直接由混合接种平铺至尼龙袋上，物料在输送时完成发酵过程，为节约发酵室占地面积，该发酵设备由上至下分成为若干层，设备内部通常有加温、排风、监测等辅助部件。该设备可实现连续化生产作业，但需要指出的是该设备大部分材质均为不锈钢。
二手发酵设备的使用操作步骤：
校正pH电极和溶氧电极。罐体灭菌。根据需要将培养基配入罐体，按要求封好后将罐体放入大灭菌锅灭菌。待罐体冷却后，将其置于发酵台上，安装完好；打开冷却水，打开气泵电源，连接通气管道开始通气，调节进气旋钮使通气量适当；打开发酵罐电源，设置温度、pH、搅拌速度等，。待温度稳定，各项参数都正确后，将预摇好的种子接入，开始发酵计时，并开始记录各种参数。
随着分子生物工程的不断发展，已经为优良菌种的选育提供了更为广阔的天地，用基因重组菌种取，改良原有的柠檬酸、青霉素菌种已见诸报道。
基因工程手段改造传统的发酵工业，已经不是遥遥无期的事，如果我们不努力攻关，分子生物工程技术优势很可能在新一轮的竞争中失去。
随着发酵罐的日益大型化，它与手工麸曲制备的矛盾越来越突出，实现麸曲制备的工业化，或之以孢子粉，是多年未能突破的难题。自然，为想的是制成孢子粉或采用固定化技术，只是技术难度很高。
目前更为现实的，是以固体发酵改变落后的麸曲制备工艺。现在固体发酵罐早已问世，已有应用生物制药、酶制剂、制曲等工业的报道。
如一种立式多层固体发酵罐，投料行空罐灭菌。物料从顶部加料孔进入，然后进行蒸煮、灭菌，物料降温通过内蛇管、外夹套冷却，罐底进入无菌空气，从罐顶排出，达到通气、恒温要求。
