在临床实验室，操作感染性标本时或作病原体分离培养、制备菌种时会因为样品的振荡、摇动、倾注、搅拌、移液等操作或液体的洒落，产生肉眼看不见的直径<5／zrn的气溶胶或产生直径为5～100肿的液滴，这些微粒中含有活的致病微生物，可以被操作者吸入或污染工作台面上的其他样品。
生物安全柜是一种设备，它的作用就是有效地降低实验室获得性感染的机会，减少人与样品或样品与样品之间交叉污染的机会，用于保护操作人员，保护实验室环境，保护实验材料的生物安全。
生物安全柜的选择基本取决于生物试验中所使用的试验品类型：
1.如果生物试验中只涉及微生物样品，可以使用基本类型的生物安全柜；
2.如果生物试验中涉及微生物样品与微量化学试剂（非腐蚀性），使用装备外排管道的安全柜是必要的。
3.如果生物试验中涉及了细胞毒素类药物，例如，各类癌症治疗药物，必须使用的细胞毒素安全柜。
另外，需要明确了解生物安全柜与通风柜/超净工作台的区分，通风柜和超净工作台不属于生物安全柜，不可使用在涉及微生物材料的实验或生产过程中。
通风柜（通风橱）是为在化学实验过程中清除腐蚀性化学气体和有毒烟雾而设计的；由于没有装备HEPA过滤器，通风柜不能有效清除微生物介质；放置在通风柜内微生物样品会散播到柜外，污染实验室环境。
超净工作台（超净台）是为了保护试验品或产品而设计的，通过吹过工作区域的垂直或水平层流空气防止试验品或产品受到工作区域外粉尘或细菌的污染。一旦微生物样品放置于工作区域，层流空气将把带有微生物介质的空气吹向前台工作人员而产生危险。
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