生物安全柜在使用过程中不可避免地会出现各种污染，这时就需要我们对它进行清洁，那么怎么做才算是有效的清洁呢？
1、首先，对一、二类生物安全柜的污染进行清理时，应使用能独立产生、循环和中和甲醛气体的设备。将适量的多聚甲醛（空气中终浓度达到0.8%）置于电加热板（控制在安全柜外）上方的长柄锅中。
2、然后将比多聚甲醛多10%的碳酸氢铵放入另一个长柄锅中（控制在安全柜外）。将锅放在柜外的第二个加热板上，将电加热板连接到安全柜外的插头上，通电。如有必要，可将电源插头切换到柜外，以控制面板的运行。
如果相对湿度低于70%，应在安全柜内放置一个装有热水的开口容器，然后用强力胶带[如管带]密封前封闭板。如果前面没有封闭板，用大塑料布盖住前面的开口和排气口，以确保气体不会泄漏到房间里。同时，电源线穿过前盖板的通孔必须用胶带密封。
用聚甲醛板插入加热板并打开电源。待多聚甲醛*挥发后，拔下插头，切断电源，让生物安全柜静置至少6小时。然后将第二个锅插入加热板，通电蒸发碳酸氢铵。然后拔掉电源插头，打开安全柜两次，每次启动约2秒，让碳酸氢铵气体循环。在取下前封闭板（或塑料片）和排气面罩之前，让安全柜静置30分钟。使用前擦去安全柜表面的残留物。