目前的包装设备和包装材料存在的问题在于材质落后，技术含量不高。对于包装材料而言，主要还是质量稳定性的问题，不同批次的包材差异大，从而对设备的运行产生影响。
　　
　　玻璃。常用的玻璃包装容器是以硼硅成分为主，硼酸盐玻璃对水、碱性物质的耐腐蚀能力较低，与水、碱性物质长期接触或刷洗、加热灭菌，不仅使其内壁表面发毛或透明度降低，还易导致玻璃水解，释放出碱性物质和不溶性颗粒、粒状脱落物，直接影响药物的稳定性、pH值和澄明度。玻璃中还含有氧化物，易使药物氧化或分解，另外，玻璃容器的比重大、易破碎造成搬运、运输的不便，破碎后还易造成其他的伤害。
　　
　　塑料。塑料是一种合成的高分子聚合物，质轻、耐碰撞、有韧性、不易破碎。但塑料在透气性、透湿性、耐热性、化学稳定性、物理稳定性等方面较差。另外，塑料组成成分中含有一些添加剂，如稳定剂、增塑剂、抗氧剂、润滑剂、填充剂等，这些添加剂有可能迁移进入药物溶液中，而溶液中的药物也可以被塑料吸附，从而影响制剂的稳定性和药物的有效性。所以塑料容器不宜长期使用，特别是化学性质不稳定的药物不宜使用，必要时塑料容器使用前需进行物理、化学、生物毒性等实验，以确保使用安全。
　　
　　金属。铝为zui常用的金属（如铝箔、铝软管、铝塑复合管等），铝材不生锈，其氧化物无毒，遮光性好，有*的水分及气体阻隔性，加工性能好，无磁性，易开封，无回弹性，导热性大，外观有光泽，耐热耐寒性好，易与纸、塑料复合，经过处理的铝箔有很好的延展性、密闭性，对药物有充分的保护作用。但其缺点在于铝稳定性不是很好，耐腐蚀性能低，成本较其他包装材料高，遇金属离子易分解和变质的药物不宜使用。以药用铝箔为例，其标准中要求不能有直径大于0.3mm的针孔，直径在0.1～0.3mm的针孔每平方米不能多于1个，国产铝箔很难达到此标准。这一问题将严重影响铝箔的阻隔性能，尤其是用于药品的外包装时，易使氧气、水蒸气、光线穿透而使药品的药效降低。另一问题是药用铝箔厚薄不均匀，抗拉强度低。当铝箔的厚度不均匀时，使铝箔在印刷过程中粘合剂涂布量难以达到标准要求。
　　
　　橡胶。瓶装的容器大多采用橡胶垫片、橡胶垫圈或橡胶塞。用于药品包装的橡胶分为天然橡胶（即将淘汰）和丁基橡胶，这两类橡胶是高分子聚合物，具有很好的弹性，遇非常大的外力变形后能迅速恢复，易于清洗。但由于橡胶的组成复杂，在使用过程中，特别是输液瓶塞易出现针头穿刺胶塞时会产生橡胶屑或异物，直接威胁着人们的生命安全。另外，橡胶中含有异性蛋白，可对人体产生过敏反应。