QTRAP 5500 LC/MS/MS系统在同一台质谱上能提供超高灵敏度的定量分析数据和定性分析数据（能做MRM，就能做MS/MS）。它将串联四极杆的扫描方式和线性离子阱的扫描方式地结合在一起，其使成为药物发现，ADME/毒理研究，代谢组学，法医学，临床研究，环境和食品安全分析等诸多领域的超级分析平台。
其主要特点有：
创新的QJet-2离子导入技术：极大地提高了系统的灵敏度，改善了真空的分配
创新的弯曲LINAC碰撞室：提高了离子传输速度，增加了离子容量，同时有效地防止交叉污染，改善了质谱数据质量
创新的Q3线性加速技术：极大地提高了MS/MS扫描能力
的“杆-阱扫描”( MRM-IDA-EPI ) 方式：可以建立高质量的EPI质谱库
创新的AcQuRate脉冲离子计数检测器：确保系统的重现性和精确性
创新的eQ电子学设计：确保进行快速扫描和快速正负切换扫描
的气帘气接口技术：降低了污染，提高工作效率
Turbo V离子源：这是一款久经考验的高性能离子源，可适应范围的液相流速要求，有效防止电喷雾的离子抑制现象，具有自清洁探头的功能
版Analyst 1.5软件提供了的定量分析工具包，而且具有智能化的s-MRM数据采集模式
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