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细菌冷冻干燥机也称为细菌冻干机,菌种冷冻干燥机，利用细菌冷冻干燥机冻干保存是长时间保存细菌、酵母、真菌、病毒和立克次氏体的标准方法，用细菌冷冻干燥机保存的细胞其长时间活力很好，也是目前所使用的微生物保存法中效果较好和的方法。一般细菌的保存在对数生长时间，芽孢杆菌的保存在芽孢形成后再行保存。
注意事项是在冻干前一般要加冷冻保护剂，这样可使细胞免除在冷冻初期因形成冰晶而造成的损害。在实际操作中应根据不同微生物决定应用或不用防冻剂。但有的微生物不适宜应用该技术，如病原微生物在冻干过程中往往由于细胞飞溅而发生污染或感染事故，所以，对于某些病原微生物还必须使用其他的贮存方法保存。
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